En el año 1929, existían en el sector de viña Lontué dos escuelas primarias, la escuela N°13 de niñas y la escuela N°14 de hombres. Es importante señalar que en esta escuela realizó sus primeros años de estudios el ex presidente de la república que en paz Q.E.P.D don Eduardo Frei Montalva, siendo su profesora la Srta. Isolina Muñoz Arriagada.

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        El 26 de abril de 1954, se fusionaron ambas escuelas, para formar la escuela coeducacional N°14 del departamento de Lontué la que fue construida en la calle Luz Pereira s/n a un costado del Estero Seco. Dicha escuela impartía instrucciones primarias hasta sexto año básico siendo su Director Don Emilio Cárcamo. En el año 1967 la junta de vecinos y la comunidad de Lontué, solicitan al presidente de la república de esa época Don Eduardo Frei Montalva, un nuevo establecimiento para Lontué. El que fue inaugurado el 1 de Junio de 1970. como escuela N14, con una capacidad de 800 alumnos. En este mismo año. Debido a las características y tamaño de la escuela esta fue clasificada, como escuela D urbana con el número 296. Más tarde en el año 1993 .la comunidad educativa decide adoptar el nombre de Escuela Pdte. Eduardo Frei Montalva, en reconocimiento a quien durante su gobierno autorizara la construcción de la escuela.